Pascal Bonnard a soutenu sa thèse en 2011 à l’Institut d’études politiques de Paris sur le thème « Le gouvernement de l’ethnicité en Europe post-soviétique : Une sociologie politique des luttes de classification autour des populations minoritaires en Lettonie » (directeur : Georges Mink).
Il a été ATER en science politique à l’Université Paris Ouest Nanterre de 2009 à 2011 puis assistant académique et chercheur post-doctoral au campus de Natolin du Collège d’Europe (Varsovie) de 2012 à 2014.
Bénéficiaire d’une bourse Fernand-Braudel-IFER outgoing, il occupe un poste de chercheur post-doctoral à la Humboldt-Universität à Berlin d’octobre 2014 à juin 2015. Il est aussi membre suppléant du Management Committee du réseau de recherche européen Action COST IS1203 « In Search of Transcultural Memory in Europe ».