Isabelle Guinaudeau est chargée de recherches CNRS au Centre Marc Bloch. Titulaire d'un doctorat réalisé dans le cadre d'un programme franco-allemand de Sciences Po Bordeaux et de l'Université de Stuttgart, elle a passé une année à l'Institut Universitaire Européen de Florence en tant que post-doctorante avant de rejoindre le CNRS. Isabelle Guinaudeau a été rattachée au laboratoire Pacte (Sciences Po Grenoble), au Centre Émile Durkheim (Sciences Po Bordeaux) et au Centre d'études européennes (Sciences Po). Elle a effectué des mobilités en tant que professeure invitée à l'Université de Stuttgart et à l'Université de Zurich.

Ses recherches se situent à l'intersection des études électorales, de la sociologie politique et des politiques publiques. Elle analyse en particulier les stratégies de compétition partisane et les liens entre programmes électoraux et politiques publiques. Isabelle Guinaudeau est membre de l'équipe française du Comparative Agendas Project. Elle a été la chercheuse principale du projet ANR Partipol, un vaste projet sur le rôle des partis dans l'élaboration des politiques publiques, et co-dirige actuellement, avec Elisa Deiss-Helbig et Theres Matthieß, deux projets franco-allemands sur les groupes cibles des promesses électorales.